Целями деятельности Учреждения являются сохранение и изучение естественного хода природных процессов и явлений, генетического фонда растительного и животного мира, отдельных видов и сообществ растений и животных, типичных и уникальных экологических систем.

В соответствии с целями, для достижения которых создано Учреждение, Учреждение осуществляет основные виды деятельности:

• выполнение мероприятий по сохранению в естественном состоянии природных комплексов и среды обитания (противопожарные мероприятия, биотехнические мероприятия, мероприятия по охране и защите лесов, тушение лесных и иных природных пожаров, в том числе с привлечением специальных организаций, мероприятия по выделению в натуре внешних границ и границ функциональных зон территории государственного природного заповедника «Хакасский» и государственного природного заказника федерального значения «Позарым», оснащение аншлагами, информационными щитами и знаками);
• выявление и пресечение нарушений установленного режима и иных правил охраны и использования окружающей среды и природных ресурсов;
• выполнение эколого-просветительской работы (музейная и выставочная деятельность, работа со СМИ, рекламно-издательская деятельность, работа со школьниками, проведение эколого-просветительских мероприятий, приуроченных к экологическим праздникам и акциям, организация познавательного туризма);
• выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ;
• выполнение работ в области экологического мониторинга;
• обеспечение информационного, аналитического и организационного участия Учреждения и Минприроды России в рамках международного сотрудничества по вопросам организации и функционирования особо охраняемых природных территорий и выполнения мероприятий по сохранению биологического разнообразия.

В связи с этим на сотрудников заповедника «Хакасский» возлагаются следующие задачи: